TBtool

简介

1. 主要特点 — 功能齐全，界面友好，操作方便，文档丰富，自动更新
2. 开发团队 — 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 陈程杰课题组 华南农业大学园艺学院 夏瑞课题组
3. 下载地址 — GitHub 本地下载
4. 帮助文档 — 语雀网站
5. 网络视频 — 哔哩哔哩

主要功能

1. 序列处理
2. BLAST数据库搜索
3. 基因注释GO和通路分析KEGG
4. 基因富集
5. 维恩图Venn
6. 热图Heatmap
7. 全基因组数据可视化
8. 大文本或表格处理
9. 最大似然法ML建树
10. 同源基因快速查找
11. 凝胶电泳模拟

演讲文稿

1. 陈程杰课上演讲文稿：简介 | 腾讯会议录屏
2. 陈程杰课上演讲文稿：故事 | 腾讯会议录屏
3. 仝宗军课上演讲文稿：实例 | 腾讯会议录屏
4. 陈程杰课外演讲文稿：简介
5. 陈程杰课外演讲文稿：功能精选
6. 陈程杰课外演讲文稿：从用户到开发者
7. 陈程杰课外演讲文稿：开发历程

演示数据

1. 陈程杰演示数据
2. 仝宗军演示数据

参考文献

1. 陈程杰，夏瑞 — TBtools—大数据时代下的国产生物软件. 科学观察, 2022, 17(06):33-35.
2. Chen-CJ_MP2023 — TBtools-II: A "one for all, all for one" bioinformatics platform for biological big-data mining. Mol. Plant. 2023, 16:1733–1742. [PDF]
3. Chen-CJ_MP2020 — TBtools: An Integrative Toolkit Developed for Interactive Analyses of Big Biological Data. Mol. Plant. 2020, 13:1194-1202. [PDF]
4. Chen-CJ_Imeta2022 — A painless way to customize Circos plot: From data preparation to visualization using TBtools. Imeta. 04 Jul 2022, 1(3):e35 [PDF]

课外练习

1. 练习1 — 癌胚抗原家族成员双序列比对

2. 练习2 — 拟南芥和水稻SBP转录因子家族成员比对

3. 练习3 — 玉米SBP转录因子数据库构建和搜索

4. 练习4 — 玉米SBP转录因子数据集中序列提取

5. 练习5 — 韦恩图Venn Diagram分析

6. 练习6 — 热图Heatmap分析