Applied Bioinformatics Course (ABC)
实用生物信息技术

2026-05-07更新

实例4 — 玉米SBP转录因子数据集中序列提取


研究背景

  1. 基于课外练习3结果,从764个预测所得玉米转录因子数据集中提取拟南芥SPL3_ARATH相似序列

操作步骤

  1. 打开TBtools,在工具选择菜单中选择序列处理工具包Sequence Toolkit,在下拉菜单中选择FASTA格式序列提取Fasta Extract
  2. 在序列输入框中输入764个玉米转录因子 ZMTF_PEP.FAS
  3. 在输出框中选择TBtool_Example\SBP\Out\ZMTF_SPL.txt
  4. 在输入数据标识符Input ID List中逐行输入课外练习3结果中4个转录因子标识符
    PTZm00605.1
    PTZm00606.1
    PTZm00607.1
    PTZm00608.1
  5. 点击开始Start按钮,用WordPad查看结果 ZMTF_SPL.txt
  6. 结合本人研究课题,提取有关序列
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