Linux-based Essential Bioinformatics
Linux生物信息技术基础
北京大学本研合上课
第6讲 BLAST数据库搜索系统
简介
基于序列局部相似性的数据库搜索系统（Basic Local Alignment Search Tool, BLAST）是常用生物信息工具，
由美国国家生物技术信息中心NCBI负责开发、维护和更新。BLAAST系统包括通用程序和专用程序两部分。
(
NCBI BLAST主页)
通用程序包括：
- BlastP: 用蛋白质序列搜索蛋白质序列数据库
- PSI-BLAST: 位点特异性迭代BLAST (Position-specific iterated BLAST)
- DELTA-BLAST: 基于保守结构域的快速搜索(Domain Enhanced Lookup Time Accelarated BLAST)
- PHI-BLAST: 基于序列模体的数据库搜索(Pattern Hit Initiated BLAST)
- BlastN: 用核酸序列搜索核酸序列数据库
- BlastX: 将核酸序列按6条读码框翻译成蛋白质序列后搜索蛋白质序列数据库
- tBlastN: 将核酸序列数据库中的序列按6条读码框翻译成蛋白质序列，用蛋白质序列搜索翻译后得到的蛋白质序列