课程概况
- 上课时间：每周三第7-8节
- 上课地点：计算中心二层1号机房（1258房间）
- 学时学分：周学时2、总学时32，2学分
- 评分方式：课堂表现20%，小组讨论20%，课外练习30%，期末总结30%
课程简介
- 选课对象：生物信息学专业本科生，低年级研究生
- 选课要求：具有较好的生物化学和分子生物学基础，研究方向与高通量数据分析相关
- 教学方法：上机操作为主，除课堂教学外，参与课外小组讨论、完成课外练习
- 教学模式：线上线下混合模式，线上教学包括腾讯会议、电子邮件、微信
- 课程内容：Linux常用命令、vim编辑系统、BLAST数据库搜索、EMBOSS序列分析、数据库构建、转录组RNA-Seq分析等 (详见教学大纲)
参考网站
- 菜鸟教程https://www.runoob.com/
- EMBOSS程序https://www.ebi.ac.uk/jdispatcher/emboss
- HMMER隐马氏模型http://hmmer.org/
- InterPro蛋白质结构域https://www.ebi.ac.uk/interpro/