实用生物信息技术 [英文]

ABC | People | Docs | Databases | Tools | UniProt | PDB | ExPASy | EBI | NCBI | BIGD

网络文档和文献检索
姓名: 学号: 编号: 日期:

1. 分子月报(Molecular of the Month):
1) 按功能分类,该网站的生物大分子分为哪几大类?
2) 2000年12篇月报中描述的蛋白质分子,你熟悉的有哪些?
3) 有关DNA、rRNA、tRNA的月报有哪几篇?
4) 该网站中和DNA复制相关的蛋白质分子有哪些?
5) 该网站中介绍的病毒有哪些?
6) 该网站中你熟悉的酶分子有哪些?
7) 阅读该网站关于血红蛋白的短文,说明其结合和释放氧气时不同亚基之间如何协同作用。
8) 阅读该网站关于流感病毒神经氨酸酶(Influenza Neuraminidase)的短文,说明其结构特征和作用机制。
9) 列举该网站中与你研究方向相关的生物大分子。
10) 阅读你最感兴趣的生物大分子,阐述该分子的结构、功能特点。
2. 蛋白质分子精选(Protein Spotlight)
1) 和分子月报(Molecule of the Month)相比,该网站在文章内容、写作风格、数据库链接、文献引用等方面有什么特点?
2) 阅读该网站关于胰岛素分子的短文,说明作者将其称作“20世纪蛋白质分子的代表”的原因。
3) 阅读该网站关于绿色荧光蛋白(GFP)短文(The greenest of us all)以及相关文献,说明该蛋白质分子的结构功能特点。
4) 该网站中你最感兴趣的蛋白质分子有哪些?简述它们的生物学功能。
5) 该网站中与你研究方向相关的蛋白质分子有哪些?简述它们的生物学功能。
3. NCBI免费书籍(Bookshelf)
1) 浏览该免费书籍目录,与你研究方向最相关的书有哪几本?
2) 浏览该免费书籍目录,其中生物化学、分子生物学、细胞生物学和遗传学相关书籍有哪些?列出你最感兴趣的书名和作者。
3) 列举3-5个与你研究课题相关的关键词(英文);以上述关键词检索相关类别的书籍,可在哪几本书中检索到相关信息?
4) 根据上述检索信息,简述与你研究领域特别是与你课题相关的方面,已有哪些研究基础。
4. PubMed文献摘要数据库
1) PubMed生物医学文献摘要数据库和PubMed Central全文数据库有哪些主要区别?
2) PubMed医学主题词(Medical Subject Heading,MeSH)包括哪些大类?生物科学领域(Biological Science Discipline,H01.158)包括哪些学科?生物学学科(Biology,H01.158.273)包括哪些分支?遗传学分支(Genetics,H01.158.273.343)包括哪些研究方向?你的研究方向属于哪个大类?哪个领域?哪个学科?哪个分支?
3) 分子生物学(Molecular Biology)同时属于哪几个学科?哪几个分支?包括什么专题研究方向?
4) 生物信息学(Bioinformatics)在MeSH数据库中归哪个主题词?其研究方向和范围包括哪些?
5) 何谓PubMed检索Stop词?列举3-5个常见Stop词。
6) 检索你所在院系或研究所近3年来发表文献,列出与你研究方向相关的3-5篇论文目录。
7) 检索你所在院系或研究所在Science,Nature和Cell上发表的论文,列出其中你最熟悉的论文目录。
8) 检索你导师(或当前轮转导师)最近5年来发表的论文,列出3-5篇与你研究方向相关的论文目录。
9) 检索与你研究课题相关的文献,列出3-5篇最近3年内发表的论文。
10) 结合PubMed网站帮助文档和用户指南,总结PubMed文献检索的策略和经验。
5. MyNCI
1) 如何保存检索结果?
2) 如何导出检索结果?
3) 如何自动获取更新文献?
4) 简述个人文献集(My Bibliography)和普通文献集(Collection)的区别。
5) 如何将个人文献集与他人共享?
6) 如何设置文献属性筛选条件(Filter)?
7) 如何保存其它数据库检索结果?
8) 如何保存Blast搜索策略?
9) 根据以上具体用法,结合帮助文档,总结MyNCBI的特点和用途。