Applied Bioinformatics Course (ABC)
实用生物信息技术

2026-05-07更新

网络文档、文献检索


生物大分子月报 - Molecule of the Month

  1. 了解蛋白质结构数据库PDB科普短文专栏Molecule of the Month主要内容、写作风格,及其与PDB数据库的关系。
  2. 阅读血红蛋白Hemoglobin科普短文,了解血红蛋白亚基组成和四级结构、构象变化和协同作用、镰刀状贫血症的分子机制等基本知识。
  3. 阅读胰岛素、免疫球蛋白、绿色荧光蛋白、转录因子等经典蛋白质的科普文章,探索蛋白质结构和功能关系。
  4. 搜索课题相关蛋白质,阅读科普文章,并通过与PDB数据库的链接以及所提供的文献,深入了解该蛋白质的研究背景。

蛋白质分子精选 - Protein SpotLight

  1. 了解蛋白质序列数据库UniProt科普短文专栏Protein Spotlight主要内容、写作风格,及其与UniProt数据库的关系。
  2. 阅读血红蛋白Hemoglobin科普短文,了解血红蛋白研究背景及其在生命科学研究中的重要意义,了解Max Peruts对血红蛋白三维结构测定所做的贡献及其背后的故事。
  3. 阅读胰岛素、绿色荧光蛋白、肥胖症相关蛋白等经典蛋白质的科普文章,探索蛋白质结构和功能关系。
  4. 搜索课题相关蛋白质,阅读科普文章,并通过与UniProt数据库的链接以及所提供的注释信息,深入了解该蛋白质的研究背景。

网络教程

  1. 欧洲生物信息学研究所EBI网络教程 - EBI Training
  2. 伯克利大学演化生物学网络教程 - Evolution 101 [PDF]
  3. 物种演化关系树网站 - TimeTree
  4. 瑞士生物信息学研究所“探索病毒世界”网站 - Viral Zone
  5. “病毒周报”网站 - TWiV
  6. 氨基酸结构、性质和相互关系网站 - Amino Acid Properties

生物医学文献摘要数据库PubMed

  1. 通过科研人员身份证网站 ORCID 注册登录MyNCBI
  2. 了解NCBI网站生物医学文献摘要数据库PubMed的主要内容和特点。
  3. 熟练使用高级检索功能,学会快速、高效查找作者、单位和研究方向相关文献。
  4. 熟练掌握结果筛选、展示方式更改和统计等功能,对文献检索结果进行后处理。
  5. 运用相似文献和引用文献等功能,扩充检索范围。
  6. 熟练掌握文献保存、共享、导出、发送等基本功能。
  7. 利用MyNCBI工具,掌握保存检索策略、定制自动发送等高级功能。
  8. 了解医学主题词MeSH的含义和用途,熟练运用MeSH进行精准检索。

欧洲生物医学全文数据库Europe PMC

  1. 注册登录EPMC网站
  2. 浏览帮助文档、观看视频,了解EPMC的主要内容和特点。
  3. 熟练使用高级检索功能,学会快速、高效查找作者、单位和研究方向相关文献。
  4. 熟练掌握结果筛选、展示方式更改和统计等功能,对文献检索结果进行后处理。
  5. 运用相似文献和引用文献等功能,扩充检索范围。
  6. 总结EPMC和PubMed的异同

国家生物信息中心开放生物学文献数据库

  1. 网址:OpenLB
  2. 熟练使用高级检索功能,学会快速、高效查找作者、单位和研究方向相关文献。
  3. 熟练掌握结果筛选、展示方式更改和统计等功能,对文献检索结果进行后处理。
  4. 总结OpenLB和PubMed的异同

知网

  1. 网址:CNKI
  2. 熟练掌握查询结果分析导出功能
英文主页 中文主页 教学计划 课程内容 课外练习 课题实例 小组总结