UniProt课堂练习2 - 内膜蛋白

序列条目注释信息

1. 搜索UniProtKB, 输入豌豆内膜蛋白序列条目名 PPF1_PEA
2. 查看该蛋白质及其编码基因的功能
3. 查看该蛋白及其编码基因的蛋白名、基因名、物种名
4. 查看该蛋白的亚细胞定位、翻译后修饰和表达信息
5. 查看该蛋白三维空间结构，说明预测可靠性
6. 查看该蛋白家族和结构域信息，找出拟南芥中直系同源蛋白
7. 查看拟南芥叶绿体豆内膜蛋白注释信息 ALB3_ARATH

PPF1_PEA外部数据库链接

1. 查看豌豆内膜蛋白PPF1_PEA在NCBI蛋白质保守结构域数据库CDD中的信息
2. 查看豌豆内膜蛋白PPF1_PEA在EBI蛋白质整合数据库InterPro中的信息
3. 查看豌豆内膜蛋白PPF1_PEA在蛋白质家族数据库PFam中的信息
4. 查看豌豆内膜蛋白PPF1_PEA在核酸序列数据库中数据库DDBJ中的信息

ALB3_ARATH外部数据库链接

1. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在代谢通路数据库BioCyc中的信息
2. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在转运蛋白分类数据库TCDB中的信息
3. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在蛋白质无序区域数据库DisProt中的信息
4. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在蛋白质相互作用数据库STRING中的信息
5. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在拟南芥注释数据库AraPort中的信息
6. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在蛋白质丰度数据库PaxDB中的信息
7. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在蛋白质修饰数据库iPTMnet中的信息
8. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在NCBI参考序列数据库RefSeq中的核酸和蛋白质序列信息
9. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在NCBI基因数据库GeneID中的信息
10. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在拟南芥基因组数据库GrameneE中的信息
11. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在代谢通路数据库KEGG中的信息
12. 查看拟南芥内膜蛋白ALB3_ARATH在蛋白质结构数据库PDB中的信息

查看PPF1_PEA文献信息

1. 打开序列条目： PPF1_PEA
2. 点击Publication查看文献信息： Publications
3. 查看文献文献来源，找出用户审编的3篇文献： Community curated
4. 查看用户审编状况： See community submission
5. 点击页面右侧第1篇文献链接，打开PubMed数据库收录的该文献： PubMed

查看ALB_ARATH文献信息

1. 打开序列条目： ALB3_ARATH
2. 点击Publication查看文献信息： Publications
3. 查看文献文献来源（Source），找出UniProt审阅的25篇文献 UniProt reviewed
4. 点击文献类别（Catogory）中结构相关文献，找出与该蛋白质结构相关的文献： Structure
5. 点击链接EPMC, 找出并阅读该文章： EPMC

添加PPF1_PEA文献信息

1. 打开序列条目： PPF1_PEA
2. 点击Publication查看文献信息： Publications
3. 点击第1篇文献PubMed链接，打开NCBI文献摘要数据库中收录的该文献： PubMed
查看相似文献，找出需要添加的文献PMID登录号：9790595
4. 在UniProt中点击添加文献，输入欲添加文献PMID：9790595，点击提取文献信息：Retrieve Publication INFO