Applied Bioinformatics Course (ABC)
实用生物信息技术

2026-05-07更新

课外练习1 - 网络书籍、文档和文献资源检索和应用


生物大分子月报(Molecular of the Month)

  1. 按功能分类,该网站的生物大分子分为哪几大类?
  2. 2000年12篇月报中描述的蛋白质分子,你熟悉的有哪些?
  3. 有关DNA、rRNA、tRNA的月报有哪几篇?
  4. 该网站中和DNA复制相关的蛋白质分子有哪些?
  5. 该网站中介绍的病毒有哪些?
  6. 该网站中你熟悉的酶分子有哪些?
  7. 阅读该网站关于血红蛋白的短文,说明其结合和释放氧气时不同亚基之间如何协同作用。
  8. 阅读该网站关于流感病毒神经氨酸酶(Influenza Neuraminidase)的短文,说明其结构特征和作用机制。
  9. 列举该网站中与你研究方向相关的生物大分子。
  10. 阅读你最感兴趣的生物大分子,阐述该分子的结构、功能特点。

化学小分子月报(Molecular of the Month)

  1. 与生物大分子月报相比,该网站的文章内容和写作风格有何特点?
  2. 如何查看某个特定分子?
  3. 该网站收录的维生素有哪些?各有什么功能?
  4. 阅读维生素C的文章,说明其分子结构、功能,及其发现过程、后续研究。
  5. 阅读你感兴趣的化学小分子,阐述该分子的结构、功能特点。

蛋白质分子精选(Protein Spotlight)

  1. 和生物大分子月报相比,该网站在文章内容、写作风格、数据库链接、文献引用等方面有什么特点?
  2. 阅读该网站关于胰岛素分子的短文,说明作者将其称作“20世纪蛋白质分子的代表”的原因。
  3. 阅读该网站关于绿色荧光蛋白(GFP)短文(The greenest of us all)以及相关文献,说明该蛋白质分子的结构功能特点。
  4. 该网站中你最感兴趣的蛋白质分子有哪些?简述它们的生物学功能。
  5. 该网站中与你研究方向相关的蛋白质分子有哪些?简述它们的生物学功能。

演化生物学网络教程(Evolution 101)

  1. 该网站内容和写作风格有什么特点?
  2. 下载该网站中7个代表性脊椎动物的图片,写出它们的名称和特点。
  3. 认真阅读分析该网站最后Big Issue图片,说明为什么关于演化地位的梯子模型不正确,而树枝模型正确。

PubMed文献摘要数据库

  1. PubMed生物医学文献摘要数据库和PubMed Central全文数据库有哪些主要区别?
  2. PubMed医学主题词(Medical Subject Heading,MeSH)包括哪些大类?
  3. 生物领域(Biological Science Discipline,H01.158)包括哪些学科?
  4. 生物学学科(Biology,H01.158.273)包括哪些分支?
  5. 遗传学分支(Genetics,H01.158.273.343)包括哪些研究方向?
  6. 你的研究方向属于哪个大类?哪个领域?哪个学科?哪个分支?
  7. 分子生物学(Molecular Biology)同时属于哪几个学科?哪几个分支?包括什么专题研究方向?
  8. 生物信息学(Bioinformatics)在MeSH数据库中归哪个主题词?其研究方向和范围包括哪些?
  9. 何谓PubMed检索Stop词?列举3-5个常见Stop词。
  10. 检索你所在院系或研究所近3年来发表文献,列出与你研究方向相关的3-5篇论文目录。
  11. 检索你导师最近5年来发表的论文,列出3-5篇与你研究方向相关的论文目录。
  12. 检索与你研究课题相关的文献,列出最近5年内发表的论文目录。
  13. 结合PubMed网站帮助文档和用户指南,总结PubMed文献检索的策略和经验。

MyNCI

  1. 如何注册MyNCBI?
  2. 如何保存检索结果?
  3. 如何导出检索结果?
  4. 如何自动获取更新文献?
  5. 如何保存文献集(Collection)?
  6. 如何将个人文献集与他人共享?
  7. 如何设置文献属性筛选条件(Filter)?
  8. 根据以上具体用法,结合帮助文档,总结MyNCBI的特点和用途。
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